El firmware del iPhone 3.0 es probablemente responsable de algunas baterías agotándose rápidamente en los teléfonos de Apple, asegura Aaron Vronko, el director general de RapidRepair. Esta empresa fue de las primeras en realizar un despiece el iPhone 3GS. Dispositivos con el firmware v3.0 pueden a veces agotar la batería "muy rápidamente," apunta Vronko, hasta el punto que pueden no llegar a durar un dia entero sin recargar. Quejas similares han aparecido en los foros de soporte de Apple.

Algunos usuarios de los foros de Apple proponen que las baterías pueden estar afectadas por copias de respaldo corruptas de anteriores actualizaciones del firmware. Como resultado, una solución alternativa podría ser una vuelta a los ajustes de fábrica, e instalar iPhone 3.0 desde cero. Vronko sugiere que el problema podría solucionarse con iPhone 3.1, aún en fase beta.

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